1988年9月上海市卫生发展基金会成立，由汪道涵同志担任基金会第一任理事长；前卫生部长钱信忠担任基金会第一任顾问。
根据上海市政府的要求，在新医改背景下，2012年上海市医改方案明确提出“设立上海市医药卫生发展基金，鼓励社会对医药卫生事业捐资捐助”，上海市医药卫生发展基金会应运而生,也是代表医药卫生行业唯一的基金会。
“上海市医药卫生发展基金会”为一家公益性，非盈利性的公募基金会。本会登记管理机关为上海市社会团体管理局。业务主管单位为上海市卫生局。基金面向公众募捐的地域范围为上海市。
本基金会筹措资金旨在资助医药卫生公共事业、推动科技创新、扶持卫生人才、促进医学交流、发展学科建设和公共卫生事业，致力于推动本市医药卫生事业与经济、社会和谐发展，为提高人民群众健康水平做贡献。